RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 FAM205CA6NFA0 338 aa23.15■■□□□ 1.3
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NOM1-208ENST00000489850 PSMD10O75832 226 aa23.15■■□□□ 1.3
NOM1-208ENST00000489850 MARK3P27448 753 aa23.15■■□□□ 1.3
NOM1-208ENST00000489850 CYP2C18P33260 490 aa23.15■■□□□ 1.3
NOM1-208ENST00000489850 PPFIA1Q13136 1202 aa23.15■■□□□ 1.3
NOM1-208ENST00000489850 CUL4AQ13619 759 aa23.15■■□□□ 1.3
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NOM1-208ENST00000489850 ZNF302Q9NR11 478 aa23.15■■□□□ 1.3
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NOM1-208ENST00000489850 SERINC5Q86VE9 423 aa23.14■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.14■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 DISC1Q9NRI5 854 aa23.14■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 SETD4Q9NVD3 440 aa23.14■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 TRPC6Q9Y210 931 aa23.14■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 H3BQV1 296 aa23.13■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 TRAPPC10P48553 1259 aa23.13■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.13■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.13■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 SNX21Q969T3 373 aa23.13■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 CHMP2AO43633 222 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 NEMFO60524 1076 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 CAND2O75155 1236 aa23.12■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 PFKMP08237 780 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 CSF2RAP15509 400 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 GRIK4Q16099 956 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 POTEBQ6S5H4 581 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.12■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.11■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 HBP1O60381 514 aa23.11■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 SELPP16109 830 aa23.11■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 PPP2R5CQ13362 524 aa23.11■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 HIC1Q14526 733 aa23.11■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 HAS1Q92839 578 aa23.1■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.1■■□□□ 1.29
NOM1-208ENST00000489850 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.09■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 MCTP1Q6DN14 999 aa23.09■■□□□ 1.29
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NOM1-208ENST00000489850 KIF28PB7ZC32 967 aa23.07■■□□□ 1.28
NOM1-208ENST00000489850 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
NOM1-208ENST00000489850 ATP2B1P20020 1258 aa23.07■■□□□ 1.28
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NOM1-208ENST00000489850 EPHB4P54760 987 aa23.07■■□□□ 1.28
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