RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 FANCLQ9NW38 375 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 RWDD2AQ9UIY3 292 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 ASB14A6NK59 587 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 PSMA7O14818 248 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 TGFB3P10600 412 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 STX17P56962 302 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 SREBF2Q12772 1141 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA1Q5VX52 437 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 NELFBQ8WX92 580 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 HHIPL1Q96JK4 782 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 MED15Q96RN5 788 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXB3-210ENST00000489475 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB39O15060 712 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 LYPLA2O95372 231 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 PSMC5P62195 406 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 SP2Q02086 613 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 GPR142Q7Z601 462 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 HSD3B7Q9H2F3 369 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 CPA4Q9UI42 421 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 EHHADHQ08426 723 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 COASYQ13057 564 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 EEPD1Q7L9B9 569 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 MORC4Q8TE76 937 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 SLC39A2Q9NP94 309 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 PSAPP07602 524 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 GIT2Q14161 759 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 RINT1Q6NUQ1 792 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 KCNV1Q6PIU1 500 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 HPS3Q969F9 1004 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 RUSC1Q9BVN2 902 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 PLXNB2O15031 1838 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF75DP51815 510 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ACTR2P61160 394 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 SP4Q02446 784 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 CYFIP1Q7L576 1253 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 C4orf19Q8IY42 314 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0895Q8NCT3 520 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 REEP2Q9BRK0 252 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC37A2A6NM11 1700 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF35A5YM69 484 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 COBLO75128 1261 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 NEDD9Q14511 834 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ZHX3Q9H4I2 956 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 KCND2Q9NZV8 630 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 FRMD3A2A2Y4 597 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 UGCGQ16739 394 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 FAM26FQ5R3K3 315 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ATP6V0A1Q93050 837 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 SORBS3O60504 671 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 TBCAO75347 108 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 GRB14Q14449 540 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 C1orf186Q6ZWK4 172 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ATP1A3P13637 1013 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 YWHABP31946 246 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 DPP9Q86TI2 863 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ABHD15Q6UXT9 468 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ARMCX2Q7L311 632 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 GABBR1Q9UBS5 961 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.76■■■□□ 2.36
HOXB3-210ENST00000489475 TLR2O60603 784 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF18P17022 549 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 SWSAP1Q6NVH7 229 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 BICDL2A1A5D9 508 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 FANCCQ00597 558 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 GRM1Q13255 1194 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINC1P01008 464 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 CCNE1P24864 410 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 TM4SF4P48230 202 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 RARRES1P49788 294 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 P2RX5Q93086 422 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms