RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-211ENST00000489450 OXSMQ9NWU1 459 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-211ENST00000489450 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-211ENST00000489450 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-211ENST00000489450 WIZO95785 1651 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF11O15085 1522 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C1D1 291 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SEMA7AO75326 666 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBP9O95302 570 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NCAM1P13591 858 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FAHP16930 419 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 GJA4P35212 333 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ID4P47928 161 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF11P52732 1056 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 MESP2Q0VG99 397 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CR1LQ2VPA4 569 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TEPPQ6URK8 271 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 MZB1Q8WU39 189 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF38Q9H0F5 515 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 RASSF10A6NK89 507 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NEMP1O14524 444 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 N4BP3O15049 544 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 EYA4O95677 639 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 BPIP17213 487 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PFKLP17858 780 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC9A1P19634 815 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 LIMS1P48059 325 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 LSSP48449 732 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 DLG4P78352 724 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF174Q15697 407 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1958Q8N8K9 716 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNN1Q92952 543 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX11Q96FC9 970 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC1Q99614 292 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 IFT22Q9H7X7 185 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 WASF3Q9UPY6 502 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ARAP1Q96P48 1450 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TGM5O43548 720 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 MMEP08473 750 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 THBS2P35442 1172 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 EVA1CP58658 441 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX3-2P78367 333 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPRSS15P98073 1019 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 STAT4Q14765 748 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CD276Q5ZPR3 534 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 LIPIQ6XZB0 460 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 STK32CQ86UX6 486 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PROSER1Q86XN7 944 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ATL2Q8NHH9 583 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 EMC7Q9NPA0 242 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TOMM22Q9NS69 142 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CHD1O14646 1710 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXP2O15409 715 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT1P04264 644 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP2C8P10632 490 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CPEP16870 476 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SDHAP31040 664 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 MC4RP32245 332 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXO4P98177 505 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 OCRLQ01968 901 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE4AQ5TA78 99 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms