RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFHR4Q92496 578 aa5.54□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.54□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LSAMPQ13449 338 aa5.53□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.53□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.53□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYNE4Q8N205 404 aa5.53□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.53□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NELL1Q92832 810 aa5.53□□□□□ -1.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAHP16930 419 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PFKPQ01813 784 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTPAQ15257 358 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP30Q70CQ3 517 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GGT7Q9UJ14 662 aa5.52□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL18BPO95998 194 aa5.51□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.51□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 VRK3Q8IV63 474 aa5.51□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.51□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ESYT3A0FGR9 886 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF839A8K0R7 811 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TESK1Q15569 626 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD276Q5ZPR3 534 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 BVESQ8NE79 360 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLDND1Q9NY35 253 aa5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA0355O15063 1070 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 B3GALT2O43825 422 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRIN1Q05586 938 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C14orf37Q86TY3 774 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC103Q8IW40 242 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR135Q8IZ08 494 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO10Q9UK96 956 aa5.49□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMGCRP04035 888 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAP1Q03518 808 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBR1Q16650 682 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.48□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAT2P11245 290 aa5.47□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAN2A2P49641 1150 aa5.47□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.47□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPON2Q9BUD6 331 aa5.47□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.47□□□□□ -1.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC26A4O43511 780 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDE6AP16499 860 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIEF2Q96C03 454 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10A2Q9H208 303 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.46□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC27A2O14975 620 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD16AO95870 558 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 LTBRP36941 435 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCNN1GP51170 649 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FZD1Q9UP38 647 aa5.45□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITGB1P05556 798 aa5.44□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF276Q8N554 614 aa5.44□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 APBA2Q99767 749 aa5.44□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.44□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.44□□□□□ -1.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.44□□□□□ -1.54
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