RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 SWSAP1Q6NVH7 229 aa37.1■■■■□ 3.53
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CHKB-210ENST00000484266 ZNF302Q9NR11 478 aa37.1■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa37.1■■■■□ 3.53
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CHKB-210ENST00000484266 FAM160B1Q5W0V3 765 aa37.09■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 MIER3Q7Z3K6 550 aa37.09■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 RDM1Q8NG50 284 aa37.09■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 TBX21Q9UL17 535 aa37.09■■■■□ 3.53
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CHKB-210ENST00000484266 H0YGN5 161 aa37.08■■■■□ 3.53
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CHKB-210ENST00000484266 HIC1Q14526 733 aa37.08■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 BRAPQ7Z569 592 aa37.08■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 TMEM39AQ9NV64 488 aa37.08■■■■□ 3.53
CHKB-210ENST00000484266 PCDH10Q9P2E7 1040 aa37.08■■■■□ 3.53
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CHKB-210ENST00000484266 BECN1Q14457 450 aa37.06■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 PDXDC2PQ6P474 469 aa37.06■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 CTAGE1Q96RT6 745 aa37.06■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 GABBR1Q9UBS5 961 aa37.06■■■■□ 3.52
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CHKB-210ENST00000484266 PCDHA12Q9UN75 941 aa37.06■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa37.06■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 TXKP42681 527 aa37.05■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 RESTQ13127 1097 aa37.05■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 PLCB4Q15147 1175 aa37.05■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 PTGISQ16647 500 aa37.05■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 C4orf32Q8N8J7 132 aa37.05■■■■□ 3.52
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CHKB-210ENST00000484266 C17orf102A2RUQ5 167 aa37.03■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 ATP4AP20648 1035 aa37.03■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 SETD4Q9NVD3 440 aa37.03■■■■□ 3.52
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CHKB-210ENST00000484266 CYP2C9P11712 490 aa37.02■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 UGCGQ16739 394 aa37.02■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 NOD1Q9Y239 953 aa37.02■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 ITGB8P26012 769 aa37.02■■■■□ 3.52
CHKB-210ENST00000484266 PPFIA1Q13136 1202 aa37.02■■■■□ 3.52
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CHKB-210ENST00000484266 LMBR1Q8WVP7 490 aa37.02■■■■□ 3.52
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CHKB-210ENST00000484266 MARCH8Q5T0T0 291 aa36.95■■■■□ 3.51
CHKB-210ENST00000484266 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
CHKB-210ENST00000484266 FAM173BQ6P4H8 233 aa36.95■■■■□ 3.51
CHKB-210ENST00000484266 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
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CHKB-210ENST00000484266 RRN3P2A6NIE6 340 aa36.94■■■■□ 3.5
CHKB-210ENST00000484266 OATP04181 439 aa36.94■■■■□ 3.5
CHKB-210ENST00000484266 P4HBP07237 508 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
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