RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 STXBP3O00186 592 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CUL5Q93034 780 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD15Q9P1V8 674 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1G2O95670 118 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R2AP63151 447 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TBCKQ8TEA7 893 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 EPS15P42566 896 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 SLCO1A2P46721 670 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TNNI2P48788 182 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CABP7Q86V35 215 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC15Q8TF66 581 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC45Q96CN5 670 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 LONP1P36776 959 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 NAALADL2Q58DX5 795 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 BARHL2Q9NY43 387 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 FLT1P17948 1338 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 GNAQP50148 359 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TCP10Q12799 353 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C4orf32Q8N8J7 132 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 WHAMMQ8TF30 809 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC10P48553 1259 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 SNX1Q13596 522 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 WLSQ5T9L3 541 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 P2RX5Q93086 422 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2SQ16763 222 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PPP4R3AQ6IN85 833 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D5Q92609 795 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PNMA2Q9UL42 364 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DAPK3O43293 454 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM37O94972 964 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 STK4Q13043 487 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PLCB4Q15147 1175 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KA1Q15418 735 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF507Q8TCN5 953 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 THAP9Q9H5L6 903 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TMBIM4Q9HC24 238 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MLXIPLQ9NP71 852 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 IRAK4Q9NWZ3 460 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf50Q9HD87 102 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 BICDL2A1A5D9 508 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 POTEMA6NI47 508 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DRP2Q13474 957 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC41Q15345 812 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MEA1Q16626 185 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ARMC3Q5W041 872 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TTBK2Q6IQ55 1244 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CHADLQ6NUI6 762 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 AMACRQ9UHK6 382 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC3O43617 180 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 AKR1B1P15121 316 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD1Q719H9 257 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KRIT1O00522 736 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TDP2O95551 362 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 OR52Z1P0C646 297 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D16Q8TBP0 767 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NDST4Q9H3R1 872 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D7Q9P0N9 293 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MMEP08473 750 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 GYS1P13807 737 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SNAP25P60880 206 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DAAM2Q86T65 1068 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RETREG2Q8NC44 543 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF287Q9HBT7 754 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KLRC1P26715 233 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PCK1P35558 622 aa17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms