RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ANXA13P27216 316 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ARID5AQ03989 594 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 NFIAQ12857 509 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 PAK2Q13177 524 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 GIT2Q14161 759 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ARSHQ5FYA8 562 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SRLQ86TD4 932 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 FBXO11Q86XK2 927 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SPAG5Q96R06 1193 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 CES2O00748 559 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 PDXKO00764 312 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 MEIS2O14770 477 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 PPFIA4O75335 1185 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 KLRC1P26715 233 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 MRIQ9BWK5 157 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 EHD2Q9NZN4 543 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 A0A087X0T9 212 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 A6NNZ2 444 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 FTCDO95954 541 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 FAM228BP0C875 321 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 TNNC1P63316 161 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 APBA1Q02410 837 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ICA1Q05084 483 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 VPS36Q86VN1 386 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 UIMC1Q96RL1 719 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SREBF1P36956 1147 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SFR1Q86XK3 245 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 MS4A14Q96JA4 679 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 SH3GL2Q99962 352 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 REEP2Q9BRK0 252 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 GDF3Q9NR23 364 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 MYO1CO00159 1063 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 GAP43P17677 238 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 PODNQ7Z5L7 613 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 GMCL1Q96IK5 515 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 HINFPQ9BQA5 517 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 DNAJC18Q9H819 358 aa16.84■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 ATP8B3O60423 1300 aa16.83■□□□□ 0.29
C9orf3-218ENST00000482056 FLOT1O75955 427 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 UCHL3P15374 230 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 TRAF1Q13077 416 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 RPS6KA1Q15418 735 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 PBKQ96KB5 322 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 IDI2Q9BXS1 227 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.83■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 F5H6K3 240 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 MEIS1O00470 390 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 CIITAP33076 1130 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 PDE6BP35913 854 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF76P36508 570 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 CASP5P51878 434 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 KLRC3Q07444 240 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 TCP10Q12799 353 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms