RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEIS1O00470 390 aa18.52■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNGT2O14610 69 aa18.52■□□□□ 0.56
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RESP18Q5W5W9 173 aa18.52■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAML1Q92585 1016 aa18.52■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUB1Q9Y5A7 615 aa18.52■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACSL3O95573 720 aa18.51■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPRMP28827 1452 aa18.49■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCTN3O75935 186 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BBOX1O75936 387 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNYQ8ND76 341 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM206Q9H813 350 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLFQ16534 295 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF169Q8NCN4 708 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.48■□□□□ 0.55
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