RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 DGKIO75912 1065 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 DDAH1O94760 285 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ARP10275 920 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 INSRRP14616 1297 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SMARCA1P28370 1054 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CTNNB1P35222 781 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 IGBP1P78318 339 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 RBM10P98175 930 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TMEM62Q0P6H9 643 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 FUT2Q10981 343 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TIGD5Q53EQ6 642 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CCDC82Q8N4S0 544 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SEPT1Q8WYJ6 367 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 APBB2Q92870 758 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 GPRASP2Q96D09 838 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 JADE2Q9NQC1 790 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CLDND1Q9NY35 253 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 HCSTQ9UBK5 93 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PCDHA6Q9UN73 950 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PRR33A8MZF0 331 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SLC27A2O14975 620 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MBTPS2O43462 519 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MGEA5O60502 916 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PLCB4Q15147 1175 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NECTIN1Q15223 517 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PTPROQ16827 1216 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TMTC3Q6ZXV5 915 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 FIBCD1Q8N539 461 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SPPL3Q8TCT6 385 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PSTPIP2Q9H939 334 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CLEC1BQ9P126 229 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PLAGL2Q9UPG8 496 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 DMDP11532 3685 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ERICH2A1L162 156 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 EDIL3O43854 480 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CCNE2O96020 404 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ITGB1P05556 798 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 GNAT1P11488 350 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 XRRA1Q6P2D8 792 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 EP400NLQ6ZTU2 488 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NLRX1Q86UT6 975 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TMEM40Q8WWA1 233 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MSLNLQ96KJ4 702 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TCEANC2Q96MN5 208 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 UIMC1Q96RL1 719 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa12.46□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB42B2RXF5 422 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 DCXO43602 365 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 GLP2RO95838 553 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MMP1P03956 469 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RB1P06400 928 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ATP4AP20648 1035 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 TRAF1Q13077 416 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ADAM15Q13444 863 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 TMEM266Q2M3C6 531 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CREB3L3Q68CJ9 461 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 TAF2Q6P1X5 1199 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 HFE2Q6ZVN8 426 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ADHFE1Q8IWW8 467 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 VN1R2Q8NFZ6 395 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 IGFLR1Q9H665 355 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 TMEM260Q9NX78 707 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ERAP1Q9NZ08 941 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MUTYHQ9UIF7 546 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PADI3Q9ULW8 664 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ATG7O95352 703 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ACTR2P61160 394 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MTMR1Q13613 665 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SART3Q15020 963 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RASEFQ8IZ41 740 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 FANCBQ8NB91 859 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KLHL23Q8NBE8 558 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RUFY2Q8WXA3 655 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 GLG1Q92896 1179 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms