RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 A6NJR5 290 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 ADCY6O43306 1168 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KPNA6O60684 536 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 MED24O75448 989 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LGR5O75473 907 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SLITRK3O94933 977 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LYPLA2O95372 231 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP3P08254 477 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 44.1
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SH3BP4-208ENST00000462602 STAT6P42226 847 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC26A2P50443 739 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 STAT5BP51692 787 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFA8P51970 172 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 GJA9P57773 515 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 NKX3-2P78367 333 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP4A11Q02928 519 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM160A1Q05DH4 1040 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SWSAP1Q6NVH7 229 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 USP49Q70CQ1 688 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 TPH2Q8IWU9 490 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 C4orf19Q8IY42 314 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 AFAP1L1Q8TED9 768 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 NACC1Q96RE7 527 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LXNQ9BS40 222 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.733e-7■■■□□ 14.7
SH3BP4-208ENST00000462602 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CUEDC2Q9H467 287 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF302Q9NR11 478 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 RGL1Q9NZL6 768 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 GABBR1Q9UBS5 961 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 STK17AQ9UEE5 414 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1024Q9UPX6 916 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 DNM3Q9UQ16 869 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 POTEB3A0JP26 581 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF202O95125 648 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PLCG1P19174 1290 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 GRB10Q13322 594 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 POTEBQ6S5H4 581 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 OTUD6AQ7L8S5 288 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF180Q86T96 592 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.51□□□□□ -0.73
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SH3BP4-208ENST00000462602 PDILTQ8N807 584 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 BANK1Q8NDB2 785 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 ENGASEQ8NFI3 743 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 GLG1Q92896 1179 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM167AQ96KS9 214 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PNMA5Q96PV4 448 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PANK2Q9BZ23 570 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEF1Q9HAY2 307 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 NRBP2Q9NSY0 501 aa10.51□□□□□ -0.73
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SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 EMSYQ7Z589 1322 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PCNTO95613 3336 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KINO60870 393 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PGK1P00558 417 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LGALS2P05162 132 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SLFN14P0C7P3 912 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CCL5P13501 91 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LIG1P18858 919 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PTGS1P23219 599 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CST5P28325 142 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 AMPD3Q01432 767 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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SH3BP4-208ENST00000462602 XKR3Q5GH77 459 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 GNASQ5JWF2 1037 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KANK3Q6NY19 840 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CNNM3Q8NE01 707 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 DHX58Q96C10 678 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMC5Q96C12 935 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 TIGD1Q96MW7 591 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PCYT2Q99447 389 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PLIN2Q99541 437 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF208Q9H0X6 261 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.5□□□□□ -0.73
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