RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 TOP1MTQ969P6 601 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.78□□□□□ -0.84
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SH3BP1-204ENST00000459646 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP1-204ENST00000459646 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
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SH3BP1-204ENST00000459646 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP1-204ENST00000459646 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.78□□□□□ -0.84
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SH3BP1-204ENST00000459646 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 PAK2Q13177 524 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP1-204ENST00000459646 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP1-204ENST00000459646 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 SCG2P13521 617 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 KLRC1P26715 233 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 KRT76Q01546 638 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-204ENST00000459646 AP3B2Q13367 1082 aa9.74□□□□□ -0.85
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