RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429923.5

LSP1-208, Transcript of lymphocyte specific protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LSP1, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1-208ENST00000429923 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.54■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.54■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.54■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.54■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.54■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 MTMR6Q9Y217 621 aa22.54■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 CHMP2AO43633 222 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 GNAT1P11488 350 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TBX21Q9UL17 535 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 NRCAMQ92823 1304 aa22.53■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 MARK3P27448 753 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 NBR1Q14596 966 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PLCB4Q15147 1175 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PTGISQ16647 500 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 LTBP2Q14767 1821 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.52■■□□□ 1.2
LSP1-208ENST00000429923 H0YGN5 161 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 LAD1O00515 517 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 OR52Z1P0C646 297 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 TXKP42681 527 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ADAM17P78536 824 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 RESTQ13127 1097 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 EPHA7Q15375 998 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 POTEB3A0JP26 581 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 EML1O00423 815 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 HBP1O60381 514 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 SYN1P17600 705 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ATP4AP20648 1035 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 PTGDRQ13258 359 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 HIC1Q14526 733 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 POTEBQ6S5H4 581 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 FERMT3Q86UX7 667 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 SETD4Q9NVD3 440 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 NOD1Q9Y239 953 aa22.5■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 TIMP1P01033 207 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 RAG1P15918 1043 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 PPFIA1Q13136 1202 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 PTK7Q13308 1070 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 FAM167AQ96KS9 214 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 TRPC6Q9Y210 931 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.49■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 CYP2C9P11712 490 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 INSRRP14616 1297 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 PRPHP41219 470 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 GRIK4Q16099 956 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 HIPK3Q9H422 1215 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 COL1A2P08123 1366 aa22.48■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 TREHO43280 583 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ZNF862O60290 1169 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ITGB8P26012 769 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 PSMC5P62195 406 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 RBL2Q08999 1139 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 BFSP2Q13515 415 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 UGCGQ16739 394 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 SERINC5Q86VE9 423 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 CAGE1Q8TC20 777 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 NEK9Q8TD19 979 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.47■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 PITPNM1O00562 1244 aa22.46■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 BMP15O95972 392 aa22.46■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 TECP42680 631 aa22.46■■□□□ 1.19
LSP1-208ENST00000429923 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms