RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419303.5

PRAMENP-202, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,869 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-202ENST00000419303 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TRIM75PA6NK02 468 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 KLRF2D3W0D1 207 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CETPP11597 493 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CAVIN3Q969G5 261 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 PAGE5Q96GU1 130 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CHP1Q99653 195 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 MMP1P03956 469 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 SCP2P22307 547 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TNFRSF8P28908 595 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 HMGCS2P54868 508 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 INHBEP58166 350 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 GRIN1Q05586 938 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 C2orf54Q08AI8 447 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 PDCLQ13371 301 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 EMC10Q5UCC4 262 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CSRNP2Q9H175 543 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 VPS16Q9H269 839 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 BTBD18B2RXH4 712 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 KCNJ18B7U540 433 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L15C9J2P7 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L11C9JVI0 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L18D6R9N7 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L22D6RA61 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L19D6RCP7 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L20D6RJB6 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 CYTH3O43739 400 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 RASSF9O75901 435 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 IDEP14735 1019 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 RXRAP19793 462 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 AFMP43652 599 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 HERVK_113P62684 666 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 UBXN1Q04323 297 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 USP17L24Q0WX57 530 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 DPYDQ12882 1025 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 KCNJ12Q14500 433 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 SNCBQ16143 134 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TTMPQ5BVD1 217 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM212AQ96EL1 285 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 DNAJC7Q99615 494 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 JADE2Q9NQC1 790 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 PNMA2Q9UL42 364 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A1B0GUA9 196 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 PRLRP16471 622 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 CDC25AP30304 524 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 LSP1P33241 339 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 STAT2P52630 851 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 NAA35Q5VZE5 725 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 ARL8AQ96BM9 186 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 MAF1Q9H063 256 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A1W2PQC6 194 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAMENP-202ENST00000419303 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms