RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 CHST13Q8NET6 341 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 REPS2Q8NFH8 660 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 SLC5A5Q92911 643 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 GJA10Q969M2 543 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 RIT2Q99578 217 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM9Q9C026 710 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 ACAD9Q9H845 621 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO40Q9UH90 709 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 DNM3Q9UQ16 869 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 RPTORQ8N122 1335 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 PSMA7O14818 248 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 SERPINC1P01008 464 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 PLA2G4BP0C869 781 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 MUTP22033 750 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 RPA1P27694 616 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 CCND2P30279 289 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 COPB2P35606 906 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 USP46P62068 366 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 FKBP1BP68106 108 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 PDE4DQ08499 809 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 PAK1Q13153 545 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 SNAPC2Q13487 334 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 NCAPHQ15003 741 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TREML2Q5T2D2 321 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 SPATA1Q5VX52 437 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 LBX2Q6XYB7 198 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 MOB2Q70IA6 237 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 NLRX1Q86UT6 975 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 UIMC1Q96RL1 719 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 RMDN3Q96TC7 470 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 JADE2Q9NQC1 790 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 PXMP2Q9NR77 195 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 FANCLQ9NW38 375 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 COL20A1Q9P218 1284 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 VAV3Q9UKW4 847 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 RIPK3Q9Y572 518 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.4□□□□□ -1.22
HDAC8-211ENST00000415409 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 BICDL2A1A5D9 508 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MYMKA6NI61 221 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ESPNB1AK53 854 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MAFGO15525 162 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KLRC4O43908 158 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MED24O75448 989 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PSMD10O75832 226 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 AVPP01185 164 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ARP10275 920 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ITGB5P18084 799 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MMP16P51512 607 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 UBASH3AP57075 661 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FANCCQ00597 558 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SPAG1Q07617 926 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PSMD2Q13200 908 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PPP2R5CQ13362 524 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MTMR1Q13613 665 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PGM5Q15124 567 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 EPHA7Q15375 998 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 UNC13DQ70J99 1090 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.39□□□□□ -1.23
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