RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399899.1

CLDN8-201, Transcript of claudin 8, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN8, Length 2,068 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8-201ENST00000399899 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ZBTB5O15062 677 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 EPHB6O15197 1021 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 GNA14O95837 355 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CYP3A7P24462 503 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 SHMT1P34896 483 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 USP11P51784 963 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 KCNMA1Q12791 1236 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CCDC96Q2M329 555 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 DCAF15Q66K64 600 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PDXDC1Q6P996 788 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 NEK11Q8NG66 645 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 VPS18Q9P253 973 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.55□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF185O15231 689 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 AKR1B10O60218 316 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 RPS6KA5O75582 802 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MAGEA1P43355 309 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 GYS2P54840 703 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 COASYQ13057 564 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PICALMQ13492 652 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ECM1Q16610 540 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 RRAGAQ7L523 313 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 COG1Q8WTW3 980 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 KLRG1Q96E93 195 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MBOAT7Q96N66 472 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 JADE2Q9NQC1 790 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PANK4Q9NVE7 773 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 LRRC53A6NM62 1247 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ACTN2P35609 894 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 HUNKP57058 714 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 TCP10Q12799 353 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 LRRC41Q15345 812 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 UBE2SQ16763 222 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MCTP2Q6DN12 878 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CAGE1Q8TC20 777 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MKL1Q969V6 931 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 EHD4Q9H223 541 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 DEF6Q9H4E7 631 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CEP72Q9P209 647 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.54□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 USP17L10C9JJH3 530 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 SERPING1P05155 500 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 LMAN1P49257 510 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ZSCAN26Q16670 478 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 HGSNATQ68CP4 663 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 RGMBQ6NW40 437 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 CCDC102AQ96A19 550 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 RNF14Q9UBS8 474 aa9.53□□□□□ -0.88
CLDN8-201ENST00000399899 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms