RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 KLRC1P26715 233 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 ICA1Q05084 483 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 C10orf76Q5T2E6 689 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 A0A087X0T9 212 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SPDYE3A6NKU9 549 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 CALUO43852 315 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 FAM228BP0C875 321 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SREBF1P36956 1147 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 CASP5P51878 434 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 TATDN1Q6P1N9 297 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 HINFPQ9BQA5 517 aa29■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 GRID2IPA4D2P6 1211 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 CACNB3P54284 484 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 PSMC6P62333 389 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 ARID5AQ03989 594 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 MEI1Q5TIA1 1274 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 LENG9Q96B70 501 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 REEP2Q9BRK0 252 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 AFF2P51816 1311 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 PDXKO00764 312 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 AFPP02771 609 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 MMP14P50281 582 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SFR1Q86XK3 245 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 CAVIN3Q969G5 261 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 GMCL1Q96IK5 515 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 BTNL10A8MVZ5 291 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 F5H6K3 240 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 KLRC3Q07444 240 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC31Q6UY01 552 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 MS4A14Q96JA4 679 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 TSPYL1Q9H0U9 437 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 MEIS1O00470 390 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 FAM76AQ8TAV0 307 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 CIITAP33076 1130 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 PDE6BP35913 854 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 NNTQ13423 1086 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SYDE2Q5VT97 1194 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 IFT20Q8IY31 132 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 ALS2CLQ60I27 953 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6CA6NDK9 693 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA8KD6RF30 607 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 FAM86B1E9PN63 330 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 OPA1O60313 960 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 FTCDO95954 541 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6DP0CG33 693 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 HOXD13P35453 343 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SLC20A2Q08357 652 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 BMT2Q1RMZ1 405 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 USH1GQ495M9 461 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 SPAG5Q96R06 1193 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD13-201ENST00000392539 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 SNAP25P60880 206 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 IKQ13123 557 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 SH3GL2Q99962 352 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM51Q9NW97 253 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFB10O96000 172 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 ACTN1P12814 892 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 SLC9A1P19634 815 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 RPL13P26373 211 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 EXOC3L4Q17RC7 722 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD13-201ENST00000392539 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms