RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CALN1Q9BXU9 219 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 LUZP4Q9P127 313 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CNTN3Q9P232 1028 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 USP16Q9Y5T5 823 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC12A8A0AV02 714 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF10AO00220 468 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D12O60347 775 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CD86P42081 329 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ATL3Q6DD88 541 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MDM1Q8TC05 714 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FSBPO95073 299 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 OLFM2O95897 454 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GJA9P57773 515 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKCEQ02156 737 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC74AQ0VAA2 488 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SPOCK2Q92563 424 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FATE1Q969F0 183 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NTN4Q9HB63 628 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 HACD3Q9P035 362 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PHACTR2O75167 634 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RAC2P15153 192 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 STAT6P42226 847 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 AMPHP49418 695 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 BLMHQ13867 455 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP161Q6P656 301 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NATD1Q8N6N6 113 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PIP5K1AQ99755 562 aa7.44□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 STAP2Q9UGK3 403 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SBF2Q86WG5 1849 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL9O00512 1426 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 STRNO43815 780 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC166P0CW27 439 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 LSP1P33241 339 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CD97P48960 835 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMD6Q15008 389 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 HID1Q8IV36 788 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GMLQ99445 158 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFATQ9P243 1243 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TMCO1Q9UM00 188 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PIK3C2AO00443 1686 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 A6NJY4 79 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CPLX1O14810 134 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MTERF2Q49AM1 385 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PEX13Q92968 403 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CIB1Q99828 191 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.43□□□□□ -1.22
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