RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 TMC6Q7Z403 805 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC65Q8IXS2 484 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM133AQ8N9E0 248 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 P2RX5Q93086 422 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NACC1Q96RE7 527 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MAF1Q9H063 256 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EFCC1Q9HA90 598 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FRMD3A2A2Y4 597 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MAFGO15525 162 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HUNKP57058 714 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CHADLQ6NUI6 762 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf186Q6ZWK4 172 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MCM3APO60318 1980 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TRPM7Q96QT4 1865 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM150BA6NC51 233 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TEX33O43247 280 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SP4Q02446 784 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NR1I3Q14994 352 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 COBLL1Q53SF7 1204 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FAM26FQ5R3K3 315 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 EEPD1Q7L9B9 569 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN30Q86W11 494 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FGD4Q96M96 766 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MMP19Q99542 508 aa17.07■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 QARSP47897 775 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 LRMPQ12912 555 aa17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CENPPQ6IPU0 288 aa17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM47Q96LD4 638 aa17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PNMA3Q9UL41 463 aa17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MYH11P35749 1972 aa17.06■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CBFA2T2O43439 604 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MUTP22033 750 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 KRT31Q15323 416 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SFR1Q86XK3 245 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD17Q8N5Z5 321 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 KCNJ18B7U540 433 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 STAM2O75886 525 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CASP5P51878 434 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 KRT76Q01546 638 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 KCNJ12Q14500 433 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GNPTABQ3T906 1256 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TCP11X2Q5H9J9 407 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CYFIP1Q7L576 1253 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD23Q86SG2 305 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 VSTM4Q8IW00 320 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 VPS16Q9H269 839 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MROH8Q9H579 483 aa17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GTH6 734 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 WDR64B1ANS9 1081 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 EDNRBP24530 442 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD2Q14681 263 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MYOCDQ8IZQ8 938 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NEK9Q8TD19 979 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SCFD1Q8WVM8 642 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TAB2Q9NYJ8 693 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 BICDL2A1A5D9 508 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ICAM3P32942 547 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 JAK3P52333 1124 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8FQ08AF8 430 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SLC9A2Q9UBY0 812 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF35A5YM69 484 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MYBP10242 640 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 YWHABP31946 246 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SFNP31947 248 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PADI6Q6TGC4 694 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms