RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP40Q9NVE5 1235 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OBP2AQ9NY56 170 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 E7EWF7 191 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRDM1O75626 825 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIMP2P16035 220 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MSX1P28360 303 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERPINB3P29508 390 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CXCL9Q07325 125 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STK3Q13188 491 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRT32Q14532 448 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC9A7Q96T83 725 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SALL1Q9NSC2 1324 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMIM22K7EJ46 135 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXP2O15409 715 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HTR3BO95264 441 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP2D6P10635 497 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPAMQ9HCL2 828 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CASS4Q9NQ75 786 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLRN2A0PK11 232 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 B4E1Z4 1266 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WNT7AO00755 349 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KPNA6O60684 536 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFAP100Q494V2 611 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STOX1Q6ZVD7 989 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RUFY3Q7L099 469 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PASD1Q8IV76 773 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SULF2Q8IWU5 870 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP33Q8TEY7 942 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDC6Q99741 560 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RUBCNLQ9H714 662 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VEZTQ9HBM0 779 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CBX8Q9HC52 389 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF181Q9P0P0 153 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEMP1O14524 444 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AK2P54819 239 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP11AP98196 1134 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNIP1Q15025 636 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DLGAP5Q15398 846 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1B0GUL6 1792 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBX3O15119 743 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RHOQP17081 205 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPARAQ07869 468 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GALEQ14376 348 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR78Q5VTH9 848 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTR9Q6PD62 1173 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRBA2Q6ZNG9 492 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZUG5 572 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCOA7Q8NI08 942 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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