RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.05■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 TNFRSF25Q93038 417 aa26.05■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 TRAPPC3O43617 180 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 LRRN2O75325 713 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 TNFAIP3P21580 790 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 GJC1P36383 396 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 ZNF76P36508 570 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 CALCOCO2Q13137 446 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 MCM8Q9UJA3 840 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 PDHA1P08559 390 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 KIF9Q9HAQ2 790 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 CYP4A11Q02928 519 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 FAM47EQ6ZV65 393 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 FAM114A2Q9NRY5 505 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 DRP2Q13474 957 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 GJB7Q6PEY0 223 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 MTA3Q9BTC8 594 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 NEUROG2Q9H2A3 272 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 ASIC3Q9UHC3 531 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 F8W031 263 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 COASYQ13057 564 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 TAF11Q15544 211 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 GNPTABQ3T906 1256 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 IFT74Q96LB3 600 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 EVI5O60447 810 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 BAG3O95817 575 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 KCNQ4P56696 695 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 ITIH3Q06033 890 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 GCNT3O95395 438 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 STX2P32856 288 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 STAT1P42224 750 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 CENPPQ6IPU0 288 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 EYA3Q99504 573 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 ATP6V1G2O95670 118 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 FGFR2P21802 821 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 ADCY7P51828 1080 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 FIGNQ5HY92 759 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 RUBCNQ92622 972 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 ECT2Q9H8V3 914 aa26.02■■□□□ 1.76
PACS2-201ENST00000325438 LAD1O00515 517 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 CDK17Q00537 523 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 MEI1Q5TIA1 1274 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 BARHL2Q9NY43 387 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SFI1A8K8P3 1242 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SPOPO43791 374 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 DDR1Q08345 913 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SNX1Q13596 522 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 MRC1P22897 1456 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 RASGRF2O14827 1237 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 HIP1RO75146 1068 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SMIM5Q71RC9 77 aa26.01■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SLC29A2Q14542 456 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 AP1ARQ63HQ0 302 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 GLYCTKQ8IVS8 523 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SYCE1Q8N0S2 351 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ZNF287Q9HBT7 754 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 PMS2P54278 862 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 MESDQ14696 234 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 BAP1Q92560 729 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 KCNG1Q9UIX4 513 aa26■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 RASSF9O75901 435 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SUN1O94901 812 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 TCP11X1B4DZS4 312 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 FBF1Q8TES7 1133 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SAAL1Q96ER3 474 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms