RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LYPLA2O95372 231 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC41Q15345 812 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNERQ8NFT8 737 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IWS1Q96ST2 819 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSG101Q99816 390 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR81Q562E7 1941 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAP43P17677 238 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SFNP31947 248 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JAK3P52333 1124 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT76Q01546 638 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HERVK_113P62684 666 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TC2NQ8N9U0 490 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RDM1Q8NG50 284 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDHR1Q96JP9 859 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP9AO75110 1047 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BANK1Q8NDB2 785 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQC6 194 aa24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGS20O76081 388 aa24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SFR1Q86XK3 245 aa24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.471e-6■■□□□ 12.7
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH11P35749 1972 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR64B1ANS9 1081 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPM2P07951 284 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUCY2CP25092 1073 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM14Q14142 442 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB39O15060 712 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNMDO75829 334 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPB2P35606 906 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNM2P50570 870 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF131P52739 623 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBXN1Q04323 297 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM139Q8IV31 216 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PANX2Q96RD6 677 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMM50Q9Y512 469 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFASCO94856 1347 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNE2O96020 404 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSPH10BP0C881 870 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNA2P16389 499 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNPTABQ3T906 1256 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP63Q96MT8 703 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC25A27O95847 323 aa24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSBPP22059 807 aa24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJA5P36382 358 aa24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNAPC2Q13487 334 aa24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C4orf19Q8IY42 314 aa24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX10O60499 249 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM13AO94988 1023 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GYPCP04921 128 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEJP0CG39 1038 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASP5P51878 434 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBL2Q08999 1139 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIIPQ5JXC2 388 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC51Q96ER9 411 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms