RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 E9PMD0 336 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 PSAPP07602 524 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 POSTNQ15063 836 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 TRIB2Q92519 343 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 RAD54LQ92698 747 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 STAMQ92783 540 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 DNM3Q9UQ16 869 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-201ENST00000312060 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ATG7O95352 703 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PNOCQ13519 176 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 A0A087WWV3 80 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PSMC6P62333 389 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 MCM6Q14566 821 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SV2BQ7L1I2 683 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 MTRQ99707 1265 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 GH1P01241 217 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PRR29P0C7W0 189 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SMPD1P17405 629 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PSMC5P62195 406 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 TNFAIP2Q03169 654 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 LAMC2Q13753 1193 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SPATA33Q96N06 139 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 NACC1Q96RE7 527 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 AMPD3Q01432 767 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 CEP350Q5VT06 3117 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 BACH1O14867 736 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PLA2G4BP0C869 781 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PTGS1P23219 599 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP1Q07960 439 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 UGCGQ16739 394 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 RAET1EQ8TD07 263 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.73■■□□□ 1.55
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CTU2-201ENST00000312060 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 LYPLA2O95372 231 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 EYA4O95677 639 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 C4orf19Q8IY42 314 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB39O15060 712 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ADCY3O60266 1144 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 CASP1P29466 404 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ZNF302Q9NR11 478 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 MYL1P05976 194 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ELNP15502 786 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 PRMT2P55345 433 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ZNF445P59923 1031 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 DPYDQ12882 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 CUL4BQ13620 913 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-201ENST00000312060 ADCY6O43306 1168 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 SLC12A3P55017 1021 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 PPTC7Q8NI37 304 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 SMARCE1Q969G3 411 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 MYMKA6NI61 221 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 SMC2O95347 1197 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 TRPV1Q8NER1 839 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-201ENST00000312060 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.69■■□□□ 1.54
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