RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 FAM50BQ9Y247 325 aa20.28■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 TTC3P53804 2025 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 RB1P06400 928 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 LINC00271P0C7V0 271 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 LTBRP36941 435 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 MTMR1Q13613 665 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.27■□□□□ 0.84
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CABP1-201ENST00000288616 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.27■□□□□ 0.84
CABP1-201ENST00000288616 COL4A6Q14031 1691 aa20.26■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.26■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.26■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 DCXO43602 365 aa20.26■□□□□ 0.83
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CABP1-201ENST00000288616 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.26■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 HYAL1Q12794 435 aa20.26■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.26■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.26■□□□□ 0.83
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CABP1-201ENST00000288616 COL19A1Q14993 1142 aa20.25■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 POTEBQ6S5H4 581 aa20.25■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.25■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 JADE2Q9NQC1 790 aa20.25■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.25■□□□□ 0.83
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CABP1-201ENST00000288616 TMTC2Q8N394 836 aa20.24■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.24■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PCYT2Q99447 389 aa20.24■□□□□ 0.83
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CABP1-201ENST00000288616 LINC01565O15544 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 DGKIO75912 1065 aa20.23■□□□□ 0.83
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CABP1-201ENST00000288616 AZI2Q9H6S1 392 aa20.23■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.23■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.23■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 MBTPS2O43462 519 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 CALM1P0DP23 149 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 CALM2P0DP24 149 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 CALM3P0DP25 149 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 IRS1P35568 1242 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PGBD1Q96JS3 809 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 M0QZ92 97 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 MAFGO15525 162 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 FANCBQ8NB91 859 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 MTA3Q9BTC8 594 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PIEZO1Q92508 2521 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 SLC27A2O14975 620 aa20.21■□□□□ 0.83
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CABP1-201ENST00000288616 NEFLP07196 543 aa20.21■□□□□ 0.83
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CABP1-201ENST00000288616 GATMP50440 423 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 CAMK1Q14012 370 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PLCB4Q15147 1175 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 MICU3Q86XE3 530 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PLVAPQ9BX97 442 aa20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CABP1-201ENST00000288616 PADI3Q9ULW8 664 aa20.21■□□□□ 0.83
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