RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 ACSL3O95573 720 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SMTNP53814 917 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SARNPP82979 210 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SLC18A3Q16572 532 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 QPCTQ16769 361 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ERFEQ4G0M1 354 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CPP00450 1065 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CYP2J2P51589 502 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 COASYQ13057 564 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CUL1Q13616 776 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CAVIN3Q969G5 261 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CHN1P15882 459 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SCTRP47872 440 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SKOR1P84550 965 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PTK2Q05397 1052 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ANKS1AQ92625 1134 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GLG1Q92896 1179 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 BARHL2Q9NY43 387 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 C6orf229H3BNL8 230 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 LAD1O00515 517 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ATP11AP98196 1134 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ENO4A6NNW6 628 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 FGFR2P21802 821 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 FGFR4P22455 802 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 DR1Q01658 176 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 FUT2Q10981 343 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SNX1Q13596 522 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CCDC6Q16204 474 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GJB7Q6PEY0 223 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 NEK9Q8TD19 979 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GCNT4Q9P109 453 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.65■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 COL18A1P39060 1754 aa16.64■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 POTEB3A0JP26 581 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CCDC169A6NNP5 214 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 POTECB2RU33 542 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 BIRC3Q13489 604 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MESDQ14696 234 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 POTEBQ6S5H4 581 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 METTL13Q8N6R0 699 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MTA3Q9BTC8 594 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 H0Y3Z8 333 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TRIM37O94972 964 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FSBPO95073 299 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NAB2Q15742 525 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PARP10Q53GL7 1025 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FUKQ8N0W3 1084 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 IQCKQ8N0W5 287 aa16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PQJ5 194 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DIAPH2O60879 1101 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 LDHCP07864 332 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 STX2P32856 288 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USH1GQ495M9 461 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FAM47EQ6ZV65 393 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.254e-7■■■■□ 20.4
USP25-201ENST00000285679 CAND2O75155 1236 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FAM13AO94988 1023 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FLT3P36888 993 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NPY5RQ15761 445 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PRR16Q569H4 304 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PBKQ96KB5 322 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms