RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5C2P49902 561 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 GJA9P57773 515 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP12P59046 1061 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 GUCY1B3Q02153 619 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGA7Q13683 1181 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 ACVR2BQ13705 512 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A14Q15043 492 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 IQCB1Q15051 598 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST3Q7LGC8 479 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 PLXNA3P51805 1871 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 ASTN1O14525 1302 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF536O15090 1300 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-201ENST00000264640 VWA5AO00534 786 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 CUTAO60888 179 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD4O95243 580 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 BMP15O95972 392 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2D6P10635 497 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2C9P11712 490 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ANTXR2P58335 489 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ICA1Q05084 483 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 WTAPQ15007 396 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 KANK3Q6NY19 840 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 APOA5Q6Q788 366 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS33Q8NF86 280 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 REPS2Q8NFH8 660 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FGD4Q96M96 766 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9A7Q96T83 725 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 VCPKMTQ9H867 229 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 DACH1Q9UI36 760 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 RIPK3Q9Y572 518 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 NID2Q14112 1375 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM187AA6NFU0 413 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 B4E1Z4 1266 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 IKBKBO14920 756 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF202O95125 648 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 DEXIO95424 95 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 AKR1B1P15121 316 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNAR1P17181 557 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SYKP43405 635 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 GABPAQ06546 454 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SYCP1Q15431 976 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 RTN1Q16799 776 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMCX2Q7L311 632 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 TLK2Q86UE8 772 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNH6Q9H252 994 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 TOMM22Q9NS69 142 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.95□□□□□ -1.14
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