RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 ALS2CR12Q96Q35 445 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 SNX12Q9UMY4 172 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 ZNF185O15231 689 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 NOL4O94818 638 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 MOCS3O95396 460 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 CASP8Q14790 479 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 HGSNATQ68CP4 663 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 LENG9Q96B70 501 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 SUGCTQ9HAC7 445 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 MLXIPQ9HAP2 919 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 PDE11AQ9HCR9 933 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 NLRC4Q9NPP4 1024 aa17.29■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 SIPA1L1O43166 1804 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 FAM86B1E9PN63 330 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 SERPING1P05155 500 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 PSMC6P62333 389 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 ATRNL1Q5VV63 1379 aa17.28■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 H3BQF6 201 aa17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 ZNF76P36508 570 aa17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 AOC3Q16853 763 aa17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 MAP9Q49MG5 647 aa17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 CNKSR1Q969H4 720 aa17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.27■□□□□ 0.36
POP4-201ENST00000221770 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 MEIS1O00470 390 aa17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CYP3A4P08684 503 aa17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 JAG1P78504 1218 aa17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.27■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 31
POP4-201ENST00000221770 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 ACBD3Q9H3P7 528 aa17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa17.27■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 MSH4O15457 936 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 EPS15P42566 896 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 RASSF7Q02833 373 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 TRAF1Q13077 416 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CCDC70Q6NSX1 233 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CREG2Q8IUH2 290 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CSRNP1Q96S65 589 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 PIK3CDO00329 1044 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 TCP1P17987 556 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 NR2F2P24468 414 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 FRMD5Q7Z6J6 570 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 GPIHBP1Q8IV16 184 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 KCTD17Q8N5Z5 321 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.26■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 A0A1W2PRG0 241 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 TLR2O60603 784 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 KCNH2Q12809 1159 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 NOX5Q96PH1 765 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 REEP2Q9BRK0 252 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 HYOU1Q9Y4L1 999 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 OPLAHO14841 1288 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CASP5P51878 434 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 ITIH3Q06033 890 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 SFR1Q86XK3 245 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 MMGT1Q8N4V1 131 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 SUPT20HQ8NEM7 779 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 OSBPL9Q96SU4 736 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 VIPAS39Q9H9C1 493 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 VAV3Q9UKW4 847 aa17.25■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 PDXKO00764 312 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 CHRNA5P30532 468 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 C7orf43Q8WVR3 580 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 FAM212AQ96EL1 285 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 AIPL1Q9NZN9 384 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 ADAM21Q9UKJ8 722 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.24■□□□□ 0.35
POP4-201ENST00000221770 EYA4O95677 639 aa17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms