RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 TEX11Q8IYF3 940 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD42Q8N9B4 389 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 HVCN1Q96D96 273 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ADAM33Q9BZ11 813 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 RCAN1P53805 252 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 MYO1EQ12965 1108 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 UNC13DQ70J99 1090 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 PARP9Q8IXQ6 854 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 KIF2BQ8N4N8 673 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.3■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L15C9J2P7 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L11C9JVI0 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L18D6R9N7 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L22D6RA61 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L19D6RCP7 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L20D6RJB6 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L24Q0WX57 530 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 USP17L6PQ6QN14 398 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ANKS1AQ92625 1134 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 CAVIN3Q969G5 261 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 LRRN2O75325 713 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 VPS41P49754 854 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 GNAQP50148 359 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 CEP95Q96GE4 821 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 CAND2O75155 1236 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 BAG3O95817 575 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 SHBGP04278 402 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ACCSLQ4AC99 568 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
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CTDP1-201ENST00000075430 GDF3Q9NR23 364 aa18.29■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 NEDD9Q14511 834 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 KCTD1Q719H9 257 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 VCPKMTQ9H867 229 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 POTEFA5A3E0 1075 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 KIF4AO95239 1232 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 POTEIP0CG38 1075 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 NAB2Q15742 525 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 SLC18A3Q16572 532 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
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CTDP1-201ENST00000075430 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
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CTDP1-201ENST00000075430 ELF1P32519 619 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 PPP2R2AP63151 447 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 CNBD1Q8NA66 436 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC45Q96CN5 670 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 NYXQ9GZU5 481 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 WHAMMQ8TF30 809 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 GRM4Q14833 912 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 RPAINQ86UA6 219 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CTDP1-201ENST00000075430 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.27■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.27■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 FUKQ8N0W3 1084 aa18.27■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.27■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PQJ5 194 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 CHMP2AO43633 222 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 ORC4O43929 436 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 FGFR4P22455 802 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 SCTRP47872 440 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 RAB34Q9BZG1 259 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 MYH7P12883 1935 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 FAM196BA6NMK8 535 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 CETN3O15182 167 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDP1-201ENST00000075430 MMEP08473 750 aa18.26■□□□□ 0.51
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