RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	RRN5	Q02983	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ROY1	Q04847	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SPO77	Q06134	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PDR8	Q06149	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FMP45	Q07651	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	COS7	Q07788	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	REX4	Q08237	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	DAP1	Q12091	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	WSC3	Q12215	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GLE1	Q12315	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MSB2	P32334	1306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FUS1	P11710	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SEC66	P33754	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	HCS1	P34243	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YKL151C	P36059	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MRPL37	P36532	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YRO2	P38079	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MUM2	P38236	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	DMA1	P38823	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CCT6	P39079	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	QRI7	P43122	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	EFM3	P47163	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RAD17	P48581	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	COQ5	P49017	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GOR1	P53839	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GPI17	Q04080	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GAD1	Q04792	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GSH2	Q08220	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TFB4	Q12004	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NFI1	Q12216	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SKS1	Q12505	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TSC13	Q99190	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MED11	Q99278	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CMP2	P14747	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YCK1	P23291	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CTS1	P29029	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	LYP1	P32487	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NPL6	P32832	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TPO5	P36029	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PIM1	P36775	1133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PFS1	P38872	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	IPT1	P38954	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TAT2	P38967	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PAC11	P40960	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ZIM17	P42844	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	IRC5	P43610	853 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	STE24	P47154	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	HXT16	P47185	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PAC10	P48363	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TOM22	P49334	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SDT1	P53078	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ROG1	P53118	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YML096W	Q04489	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CDA2	Q06703	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RRT8	Q08219	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	BSC1	Q12140	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MMP1	Q12372	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RED1	P14291	827 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.3 ms