RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HEM15	P16622	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YCR101C	P25607	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ELM1	P32801	640 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MSN4	P33749	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GTS1	P40956	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HOC1	P47124	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YGR039W	P53225	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AQR1	P53943	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CIA1	Q05583	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DUS4	Q06063	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YNG1	Q08465	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	IMG1	P25626	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MLS1	P30952	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YJR056C	P47115	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AIM24	P47127	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YGL242C	P53066	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YNL143C	P53908	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SAM50	P53969	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DCS1	Q06151	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	THI72	Q08579	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	COA6	Q3E846	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	KRE5	P22023	1365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PSK1	P31374	1356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GSH1	P32477	678 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
BLM10	YFL007W	YBR259W	P38338	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	QDR2	P40474	542 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	EFM4	P40516	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MOB2	P43563	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TWF1	P53250	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	VAC7	P53950	1165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RAD18	P10862	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CBS1	P14066	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PHO85	P17157	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	COQ8	P27697	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SRB6	P32570	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HIS6	P40545	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PHO23	P50947	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RAD59	Q12223	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RDI1	Q12434	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	JEN1	P36035	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YKL071W	P36086	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ARN1	P38731	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	EAF6	P47128	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TMS1	Q12116	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HXT4	P32467	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SKT5	P34226	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SSS1	P35179	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HNT2	P49775	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TYW3	P53177	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RAV2	Q03956	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CSI1	Q04368	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	THI7	Q05998	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPT14	P32363	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RMD5	Q12508	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HTB2	P02294	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CPR4	P25334	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DAL2	P25335	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TIM23	P32897	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HSL7	P38274	827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AGP3	P43548	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YGL138C	P53122	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AIM33	Q04516	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPH1	Q06160	661 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PPA2	P28239	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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