RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	PLP1	Q04004	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SMP3	Q04174	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MGR3	Q04472	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	POS5	Q06892	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	NFI1	Q12216	726 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ARP6	Q12509	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MDM10	P18409	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	IMG1	P25626	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MSR1	P38714	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	DBP8	P38719	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	FLO5	P38894	1075 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	FRT2	P39734	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YIL060W	P40519	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	STB2	P46679	850 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YGL108C	P53139	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PRM6	Q04705	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	IVY1	Q04934	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	FAR10	Q06001	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	GRX6	Q12438	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MET17	P06106	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MRP13	P12686	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YKL100C	P34248	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PHO90	P39535	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PEP8	P40335	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	NET1	P47035	1189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	CPR7	P47103	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SGF73	P53165	657 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	AVL9	Q12500	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ARG81	P05085	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	COR1	P07256	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	BOS1	P25385	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ERG3	P32353	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SPR1	P32603	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	CSG2	P35206	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	TPO5	P36029	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PFF1	P38244	976 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	AFG3	P39925	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MET18	P40469	1032 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	HPM1	P40481	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SYG1	P40528	902 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SNL1	P40548	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PHO86	P46956	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	VPS25	P47142	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	NUP84	P52891	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MMT1	Q03218	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	FIN1	Q03898	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	AAD15	Q08361	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	GPM3	Q12326	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	FLO11	P08640	1367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ZIP1	P31111	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YSC83	P32792	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	CSE1	P33307	960 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SEF1	P34228	1148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YFL040W	P43562	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PKP2	P53170	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	STP1	Q00947	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MCP2	Q06567	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RLM1	Q12224	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YPR089W	O13585	888 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PTP1	P25044	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	TFC1	P32367	649 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	UBP11	P36026	717 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	VMA22	P38784	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MAF1	P41910	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SAD1	P43589	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PTR3	P43606	678 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RSM23	Q01163	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SPC2	Q04969	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ARR1	Q06596	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	GSH2	Q08220	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	THI20	Q08224	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	APC9	Q12107	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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