RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	POTEG	Q6S5H5	508 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	NLRX1	Q86UT6	975 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM139	Q8IV31	216 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	RDM1	Q8NG50	284 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	NEK11	Q8NG66	645 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ERO1A	Q96HE7	468 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	WRNIP1	Q96S55	665 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	IWS1	Q96ST2	819 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	DNAJC7	Q99615	494 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SPON1	Q9HCB6	807 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	USP27X	A6NNY8	438 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CCND2	P30279	289 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	INPP5B	P32019	993 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	NF2	P35240	595 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	STAT3	P40763	770 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	GNG11	P61952	73 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CDK17	Q00537	523 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	KRT76	Q01546	638 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SPP2	Q13103	211 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	MTMR1	Q13613	665 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	COG2	Q14746	738 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SPA17	Q15506	151 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	KCNK18	Q7Z418	384 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	TPH2	Q8IWU9	490 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CPXCR1	Q8N123	301 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	MNS1	Q8NEH6	495 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	PARVG	Q9HBI0	331 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	DNAI1	Q9UI46	699 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	RPTOR	Q8N122	1335 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SHTN1	A0MZ66	631 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	VWA5A	O00534	786 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ATP2A1	O14983	1001 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CHMP2A	O43633	222 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	KRT86	O43790	486 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	GCNT3	O95395	438 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	PTPRA	P18433	802 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	CYP4A11	Q02928	519 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ADAM9	Q13443	819 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	GIT2	Q14161	759 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	ECM1	Q16610	540 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	SULF1	Q8IWU6	871 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	LRRC15	Q8TF66	581 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	DYDC2	Q96IM9	177 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	RMDN3	Q96TC7	470 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	REEP2	Q9BRK0	252 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PNKP-231	ENST00000640501	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		9.18	□□□□□ -0.94

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