RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638075.1

EFHC1-238, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-238	ENST00000638075	ADCY7	P51828	1080 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SETD4	Q9NVD3	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NID2	Q14112	1375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NRCAM	Q92823	1304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MEIS1	O00470	390 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CAND2	O75155	1236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	LGR5	O75473	907 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CA3	P07451	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SCG2	P13521	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PSMA5	P28066	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SREBF1	P36956	1147 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SP4	Q02446	784 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	AP3B2	Q13367	1082 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	IKBKE	Q14164	716 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NTRK3	Q16288	839 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PKN1	Q16512	942 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TMEM260	Q9NX78	707 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ESYT2	A0FGR8	921 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	EFCAB14	O75071	495 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ARHGEF15	O94989	841 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	AR	P10275	920 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	KCNJ6	P48051	423 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	DEFB103A	P81534	67 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TAP1	Q03518	808 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	FAM26D	Q5JW98	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PGBD1	Q96JS3	809 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PCYT2	Q99447	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ANO3	Q9BYT9	981 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NFASC	O94856	1347 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TLL1	O43897	1013 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ATG7	O95352	703 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NEFL	P07196	543 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CYP3A4	P08684	503 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	GLG1	Q92896	1179 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RAD9A	Q99638	391 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	FAM86B1	E9PN63	330 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	GJB5	O95377	273 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CHRNA1	P02708	482 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	IFNAR1	P17181	557 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	IGFBP4	P22692	258 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ACTR2	P61160	394 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PHKB	Q93100	1093 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SDF4	Q9BRK5	362 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.59	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms