RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	KLK7	P49862	253 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	BMP6	P22004	513 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CTNNA2	P26232	953 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	ZNF76	P36508	570 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SLC1A4	P43007	532 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SEPT2	Q15019	361 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	ERF	P50548	548 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	TTMP	Q5BVD1	217 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	GREM2	Q9H772	168 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CREB3	O43889	395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CIB2	O75838	187 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	COG7	P83436	770 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	ACSL3	O95573	720 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CHN1	P15882	459 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	CETN1	Q12798	172 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	COL15A1	P39059	1388 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PXN-222	ENST00000637624	RAD51C	O43502	376 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GNAT1	P11488	350 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	STXBP3	O00186	592 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FANCG	O15287	622 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PRKAB2	O43741	272 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FGG	P02679	453 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GLI1	P08151	1106 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FAM153C	Q494X1	144 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GLI3	P10071	1580 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GNAQ	P50148	359 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	HERVK_113	P62684	666 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CUL3	Q13618	768 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	THAP12	O43422	761 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TRAF1	Q13077	416 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3

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