RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636060.1

LIN28B-AS1-202, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIN28B-AS1, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q4G0T1 1027 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PRR16Q569H4 304 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C8orf76Q96K31 380 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UIMC1Q96RL1 719 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PCYT2Q99447 389 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM39AQ9NV64 488 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SCN5AQ14524 2016 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 EMSYQ7Z589 1322 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 H3BRB1 525 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MSH4O15457 936 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SLC37A4O43826 429 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LGR5O75473 907 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATG7O95352 703 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HOXC8P31273 242 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHMP4BP1P59074 171 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ACTR2P61160 394 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CUL4AQ13619 759 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRIM29Q14134 588 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NEK8Q86SG6 692 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SLC5A5Q92911 643 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BADQ92934 168 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SDF4Q9BRK5 362 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MUC3AQ02505 3323 aa11.65□□□□□ -0.54
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 WNT7AO00755 349 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TIMP1P01033 207 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CYP2C9P11712 490 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LETM2Q2VYF4 491 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GJA10Q969M2 543 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SIP14410 1827 aa11.64□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIF28PB7ZC32 967 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PSMD10O75832 226 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RAG1P15918 1043 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GJB2P29033 226 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BMP8BP34820 402 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C7orf31Q8N865 590 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RIT2Q99578 217 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HIPK3Q9H422 1215 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CYP2C18P33260 490 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 EPHB4P54760 987 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ADAM17P78536 824 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KRT76Q01546 638 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTGISQ16647 500 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MFSD5Q6N075 450 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 POTEDQ86YR6 584 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AFAP1L1Q8TED9 768 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 WNT8BQ93098 351 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.62□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GAS7O60861 476 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms