RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 COL19A1Q14993 1142 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM26DQ5JW98 314 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEBQ6S5H4 581 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SMC5Q8IY18 1101 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 LMAN2LQ9H0V9 348 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM6O15303 877 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 BMPR1AP36894 532 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFLR1Q9H665 355 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf67A6NJJ6 358 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL18Q96ME1 805 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TELO2Q9Y4R8 837 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMPD4Q14CM0 1322 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 NRCAMQ92823 1304 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf67F2Z3F1 127 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 CYTH3O43739 400 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA1P02708 482 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 IRS1P35568 1242 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 LTBRP36941 435 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 NHLH1Q02575 133 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 HYAL1Q12794 435 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RUFY4Q6ZNE9 571 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH3Q86UC2 560 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 CUL5Q93034 780 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 WTAPQ15007 396 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM17P78536 824 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 NUCB1Q02818 461 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 PPFIA1Q13136 1202 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF2Q6P1X5 1199 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 HFE2Q6ZVN8 426 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRX1Q86UT6 975 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 MBTPS2O43462 519 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 LPIN1Q14693 890 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SART3Q15020 963 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNH6Q9H252 994 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 IL25Q9H293 177 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SENP2Q9HC62 589 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 MUTYHQ9UIF7 546 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 MARK3P27448 753 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 CTC1Q2NKJ3 1217 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD14AQ96MC6 490 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SENP7Q9BQF6 1050 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.642e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 PCNX4Q63HM2 1172 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L6PQ6QN14 398 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 CATIPQ7Z7H3 387 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 EHMT1Q9H9B1 1298 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 CD207Q9UJ71 328 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBE1Q9UJT0 475 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-217ENST00000629983 STXBP3O00186 592 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ENPP3O14638 875 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00271P0C7V0 271 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFV1P49821 464 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 MGAT3Q09327 533 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIK4Q16099 956 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R3CQ969Q6 453 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01565O15544 149 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX10O75333 385 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP1P03956 469 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 TROAPQ12815 778 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 XRRA1Q6P2D8 792 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF135Q8IUD6 432 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB3Q8WWF6 145 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 GLG1Q92896 1179 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CDY2AQ9Y6F7 541 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRC5Q86WI3 1866 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 IGBP1P78318 339 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO47Q5MNV8 452 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 PLVAPQ9BX97 442 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 PKD2L1Q9P0L9 805 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHDP01880 384 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 AAMPQ13685 434 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT1Q8WYJ6 367 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ERAP1Q9NZ08 941 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP21A2P08686 494 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOA7Q8NI08 942 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO7AQ13402 2215 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKIO75912 1065 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CD52P31358 61 aa31.46■■■□□ 2.63
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