RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 THPOP40225 353 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM178BQ8IXR5 827 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.65■■■□□ 2.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-216ENST00000628306 BANK1Q8NDB2 785 aa27.57■■■□□ 2
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