RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621941.1

5S_rRNA.18-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 110 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TRAPPC10P48553 1259 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MECP2P51608 486 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 AK2P54819 239 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CYP27A1Q02318 531 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LMOD3Q0VAK6 560 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 STK3Q13188 491 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GBX1Q14549 363 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC9A5Q14940 896 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 UGT8Q16880 541 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LONRF1Q17RB8 773 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KIAA0753Q2KHM9 967 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 UVSSAQ2YD98 709 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 INAVAQ3KP66 663 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CT83Q5H943 113 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TOR2AQ5JU69 321 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF787Q6DD87 383 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 OGFOD3Q6PK18 319 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CYP2R1Q6VVX0 501 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF354CQ86Y25 554 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CREG2Q8IUH2 290 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TEX2Q8IWB9 1127 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SIRT2Q8IXJ6 389 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FAM20CQ8IXL6 584 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 IFNL2Q8IZJ0 200 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NLGN4XQ8N0W4 816 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CPXCR1Q8N123 301 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 USHBP1Q8N6Y0 703 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF610Q8N9Z0 462 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LINC00116Q8NCU8 138 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MYRIPQ8NFW9 859 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC35G2Q8TBE7 412 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LMBR1Q8WVP7 490 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 JADE3Q92613 823 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 UBE2FQ969M7 185 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MYRFLQ96LU7 910 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ACAP3Q96P50 834 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC2A13Q96QE2 648 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GPR62Q9BZJ7 368 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MS4A5Q9H3V2 200 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NLRC4Q9NPP4 1024 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PLCB1Q9NQ66 1216 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ACSS2Q9NR19 701 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 C1GALT1Q9NS00 363 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RIC8BQ9NVN3 520 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GULP1Q9UBP9 304 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MSRAQ9UJ68 235 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DSEQ9UL01 958 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PHTF1Q9UMS5 762 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DMTF1Q9Y222 760 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NUB1Q9Y5A7 615 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ATP23Q9Y6H3 246 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa2.26□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRAMEF25A6NGN4 478 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TRIM75PA6NK02 468 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 H7BY64 318 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FZD9O00144 591 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 WNT9AO14904 365 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NBNO60934 754 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DTNBO60941 627 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPFIA4O75335 1185 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF205O95201 554 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 AMY2AP04746 511 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LPLP06858 475 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLURP2P0DP57 97 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MTHFD2P13995 350 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 AMY2BP19961 511 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NOS3P29474 1203 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GPR3P46089 330 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC5A3P53794 718 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC16A1P53985 500 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PHC1P78364 1004 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CCT2P78371 535 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KRT85P78386 507 aa2.25□□□□□ -2.05
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms