RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TTC37Q6PGP7 1564 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 IFNAR1P17181 557 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PI4K2BQ8TCG2 481 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 EFHD1Q9BUP0 239 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 NDST4Q9H3R1 872 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 NFU1Q9UMS0 254 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SKIP12755 728 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ABCD1P33897 745 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 BIRC2Q13490 618 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 EMBQ6PCB8 327 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 MCUQ8NE86 351 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 GOLGA8SH3BPF8 625 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 MAPK13O15264 365 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 HSPA2P54652 639 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PLA2G4BP0C869 781 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 LRRC63Q05C16 580 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PRKAB2O43741 272 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 XDHP47989 1333 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 GSTA4O15217 222 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 FAM47CQ5HY64 1035 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SPC25Q9HBM1 224 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 WDR91A4D1P6 747 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TRPA1O75762 1119 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 OSBP2Q969R2 916 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ATG3Q9NT62 314 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 LEMD3Q9Y2U8 911 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ATP7BP35670 1465 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PTPREP23469 700 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CCNYQ8ND76 341 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TLK1Q9UKI8 766 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 XPOTO43592 962 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CYP27A1Q02318 531 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ART3Q13508 389 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ATG16L1Q676U5 607 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 COA7Q96BR5 231 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ZSWIM5Q9P217 1185 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ATP1A3P13637 1013 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 NECTIN1Q15223 517 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ERVK-7P63135 1459 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CCND2P30279 289 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CDC25AP30304 524 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SLC16A2P36021 539 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SERPINI1Q99574 410 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ZNF449Q6P9G9 518 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 RNF207Q6ZRF8 634 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 DNAAF3Q8N9W5 541 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 APOL6Q9BWW8 343 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 SNX25Q9H3E2 840 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ANLNQ9NQW6 1124 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 MAML1Q92585 1016 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 PARVGQ9HBI0 331 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 FIS1Q9Y3D6 152 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ARL4AP40617 200 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 POLE2P56282 527 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 CENPUQ71F23 418 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 INTUQ9ULD6 942 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 IQCB1Q15051 598 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 LLGL1Q15334 1064 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 TERF2Q15554 542 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 BBS5Q8N3I7 341 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ZNF521Q96K83 1311 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 DCTN3O75935 186 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 MAGEA9P43362 315 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ARID5BQ14865 1188 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 SPICE1Q8N0Z3 855 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ATP6V1E2Q96A05 226 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 CCDC138Q96M89 665 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 BPIFA3Q9BQP9 254 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB17Q13105 803 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 RPS6KC1Q96S38 1066 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-220ENST00000611415 SH3GLB2Q9NR46 395 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms