RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604859.1

NEK4P3-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene NEK4P3, Length 544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P3-201ENST00000604859 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 NLRX1Q86UT6 975 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 TRIM50Q86XT4 487 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 CUL5Q93034 780 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 IL17RAQ96F46 866 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 MAP3K14Q99558 947 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.8□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 PIK3CDO00329 1044 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 MEIS2O14770 477 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 CHRNA1P02708 482 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 SMARCA1P28370 1054 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 SP4Q02446 784 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 RPAINQ86UA6 219 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 FIBCD1Q8N539 461 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.79□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 COL4A6Q14031 1691 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 RB1P06400 928 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 ALADP13716 330 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 KIF5BP33176 963 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 ANTXR2P58335 489 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 TTC3P53804 2025 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK4P3-201ENST00000604859 PRR33A8MZF0 331 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ENPP3O14638 875 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 NCK2O43639 380 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ATP9AO75110 1047 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 BMPR1AP36894 532 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 COL19A1Q14993 1142 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RSPH3Q86UC2 560 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MAP4K1Q92918 833 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 GPRASP2Q96D09 838 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CDHR1Q96JP9 859 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 LY9Q9HBG7 655 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 FAM50BQ9Y247 325 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 SGSM2O43147 1006 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 DDAH1O94760 285 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 GHRP10912 638 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 KCNA2P16389 499 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CTNNB1P35222 781 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 GNAQP50148 359 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MGAT3Q09327 533 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CASC1Q6TDU7 716 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 TMTC2Q8N394 836 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MYL10Q9BUA6 226 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ITGB5P18084 799 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PPFIA1Q13136 1202 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 LPIN1Q14693 890 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 GRIK4Q16099 956 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 GLG1Q92896 1179 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MTA3Q9BTC8 594 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CLDND1Q9NY35 253 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 C5orf42Q9H799 3197 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 POTEB3A0JP26 581 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 GRM6O15303 877 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MAFGO15525 162 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 LINC00271P0C7V0 271 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MARK3P27448 753 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 LTBRP36941 435 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MTMR1Q13613 665 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 POTEBQ6S5H4 581 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms