RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590096.1

ATG4D-212, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 1,282 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-212ENST00000590096 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 H3BRB1 525 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 SLC37A4O43826 429 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 MARCH6O60337 910 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 GAS7O60861 476 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 PDCP20941 246 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 KRT76Q01546 638 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 SLC5A5Q92911 643 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 RIT2Q99578 217 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 KIF28PB7ZC32 967 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 CLTBP09497 229 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 TRIM50Q86XT4 487 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 C7orf31Q8N865 590 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 GLG1Q92896 1179 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 AZI2Q9H6S1 392 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 HAS3O00219 553 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 CCNE2O96020 404 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 ATP2B1P20020 1258 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 FAM20AQ96MK3 541 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ATG4D-212ENST00000590096 EMSYQ7Z589 1322 aa24.08■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 TBX3O15119 743 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 POTEDQ86YR6 584 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 GJA10Q969M2 543 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SAMM50Q9Y512 469 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 H0YGN5 161 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 BACH1O14867 736 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 LGR5O75473 907 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PSMD10O75832 226 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 ATG7O95352 703 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SYN1P17600 705 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 TRAPPC10P48553 1259 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 FAAP100Q0VG06 881 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SESTD1Q86VW0 696 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 NOD1Q9Y239 953 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 WDR64B1ANS9 1081 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 CHMP2AO43633 222 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 B4GALT4O60513 344 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 NEMFO60524 1076 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 CD4P01730 458 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PSAPP07602 524 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 MARK3P27448 753 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SFNP31947 248 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 MCM7P33993 719 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 STAT5BP51692 787 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 JAK3P52333 1124 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 CALCRLQ16602 461 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 TTC38Q5R3I4 469 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PCYT2Q99447 389 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF302Q9NR11 478 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 DISC1Q9NRI5 854 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 WNT7AO00755 349 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 PTGISQ16647 500 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 KIAA0355O15063 1070 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SYT1P21579 422 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 SLC26A2P50443 739 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF174Q15697 407 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms