RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.11■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 BARHL2Q9NY43 387 aa28.11■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 LCHNA4D1U4 455 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 EPOPA6NHQ4 379 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 KIF28PB7ZC32 967 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 TLL1O43897 1013 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 LGR5O75473 907 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ARHGAP4P98171 946 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 TAP1Q03518 808 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ANO3Q9BYT9 981 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.1■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ADAMTS3O15072 1205 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 PPFIA3O75145 1194 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 MARK3P27448 753 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ADAM17P78536 824 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 IKBKEQ14164 716 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.09■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ARP10275 920 aa28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 RPS6KB1P23443 525 aa28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ARNTL2Q8WYA1 636 aa28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 ZBED2Q9BTP6 218 aa28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 PTPRSQ13332 1948 aa28.08■■■□□ 2.09
TOMM40-205ENST00000589649 GNAT1P11488 350 aa28.07■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 RCAN1P53805 252 aa28.07■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.07■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 GLG1Q92896 1179 aa28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 PCYT2Q99447 389 aa28.06■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 MAFGO15525 162 aa28.05■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 REC8O95072 547 aa28.05■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 SCG2P13521 617 aa28.05■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 KRT40Q6A162 431 aa28.05■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 EMSYQ7Z589 1322 aa28.05■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 PHKBQ93100 1093 aa28.05■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 NRCAMQ92823 1304 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 GJB5O95377 273 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 PPFIA1Q13136 1202 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 PKN1Q16512 942 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 CEP55Q53EZ4 464 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 UIMC1Q96RL1 719 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.04■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.03■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 SREBF1P36956 1147 aa28.03■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 GRIK4Q16099 956 aa28.03■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.03■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.03■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 EFCAB14O75071 495 aa28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 PSMA5P28066 241 aa28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF76P36508 570 aa28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 IGBP1P78318 339 aa28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 AP3B2Q13367 1082 aa28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 RAD9AQ99638 391 aa28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.02■■■□□ 2.08
TOMM40-205ENST00000589649 MEIS1O00470 390 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 CAND2O75155 1236 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 CHRNA1P02708 482 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 NEFLP07196 543 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 ACTR2P61160 394 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 FBXL16Q8N461 479 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 SEPT8Q92599 483 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 SDF4Q9BRK5 362 aa28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 FAM86B1E9PN63 330 aa28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 FAM86B2P0C5J1 330 aa28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 NTRK3Q16288 839 aa28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 FAM26DQ5JW98 314 aa28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 MTUS1Q9ULD2 1270 aa28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 CUL9Q8IWT3 2517 aa28■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 NID2Q14112 1375 aa27.99■■■□□ 2.07
TOMM40-205ENST00000589649 NFASCO94856 1347 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms