RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1024Q9UPX6 916 aa34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEB3A0JP26 581 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP2AO43633 222 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 COBLO75128 1261 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEBQ6S5H4 581 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 DPP9Q86TI2 863 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MTRQ99707 1265 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PKD2L1Q9P0L9 805 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR64B1ANS9 1081 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR29P0C7W0 189 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ECM1Q16610 540 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC15Q8TF66 581 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 NLRP12P59046 1061 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPT14Q6ZU15 432 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 DNM3Q9UQ16 869 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 P4HBP07237 508 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP2K2P36507 400 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 NEDD9Q14511 834 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MORN1Q5T089 497 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf25Q9BPX7 421 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SLITRK3O94933 977 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CNNM4Q6P4Q7 775 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMCX2Q7L311 632 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 RMND1Q9NWS8 449 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9A2Q9UBY0 812 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 THSD7BQ9C0I4 1608 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 AOC2O75106 756 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 DYDC2Q96IM9 177 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CFHR5Q9BXR6 569 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 VTA1Q9NP79 307 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEFA5A3E0 1075 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXC6P09630 235 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP2K5Q13163 448 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEGQ6S5H5 508 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK18Q7Z418 384 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SOCS4Q8WXH5 440 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 STAMQ92783 540 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MAML3Q96JK9 1138 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM9Q9C026 710 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 RGL1Q9NZL6 768 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMM50Q9Y512 469 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4A11Q02928 519 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CUL4BQ13620 913 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MCM6Q14566 821 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 ANO6Q4KMQ2 910 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 NACC1Q96RE7 527 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MAN1B1Q9UKM7 699 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPLA2O95372 231 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 IRF5Q13568 498 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNB1Q14721 858 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TPH2Q8IWU9 490 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 EYA4O95677 639 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G4BP0C869 781 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MORC3Q14149 939 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM200AQ8TCP9 573 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SCFD2Q8WU76 684 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 LXNQ9BS40 222 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 E9PMD0 336 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNE2O96020 404 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 QARSP47897 775 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MRE11P49959 708 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 BLZF1Q9H2G9 400 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH11P35749 1972 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 BIN1O00499 593 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 RPN1P04843 607 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SP2Q02086 613 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TTLL4Q14679 1199 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 USP6NLQ92738 828 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 RBSNQ9H1K0 784 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 DACH1Q9UI36 760 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 PSAPP07602 524 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 EEPD1Q7L9B9 569 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MLKLQ8NB16 471 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TINF2Q9BSI4 451 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC25Q9H1X3 360 aa34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms