RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	ACTR2	P61160	394 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	HAS3	O00219	553 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	BMP15	O95972	392 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	F2	P00734	622 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	LGALS2	P05162	132 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SP4	Q02446	784 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SNX17	Q15036	470 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	KAT2B	Q92831	832 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900		H3BRB1	525 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	BRD1	O95696	1058 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	F13A1	P00488	732 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PSAP	P07602	524 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PRPH	P41219	470 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SLC26A2	P50443	739 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	CDK7	P50613	346 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PTGDR	Q13258	359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	NBR1	Q14596	966 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	GJA10	Q969M2	543 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKN1-208	ENST00000586900	ARVCF	O00192	962 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	DDIT3	P35638	169 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	TXK	P42681	527 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	PSEN2	P49810	448 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	STAT5B	P51692	787 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	PKP1	Q13835	747 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	PCYT2	Q99447	389 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19	7e-7	■■■□□ 17
PKN1-208	ENST00000586900	NUCB2	P80303	420 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	PDIA5	Q14554	519 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	MFSD10	Q14728	455 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	EPHA7	Q15375	998 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	GLG1	Q92896	1179 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKN1-208	ENST00000586900	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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