RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580813.1

VNN3-214, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 5

Gene VNN3, Length 558 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-214ENST00000580813 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.57□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.57□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 BLACEA4D250 179 aa7.56□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 KLHL18O94889 574 aa7.56□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 NSMFQ6X4W1 530 aa7.56□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 STPG3Q8N7X2 389 aa7.56□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 DNERQ8NFT8 737 aa7.56□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.56□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 Q6ZUG5 572 aa7.55□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.55□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.54□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.54□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.53□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 SELENOPP49908 381 aa7.53□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
VNN3-214ENST00000580813 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.53□□□□□ -1.2
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VNN3-214ENST00000580813 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.52□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
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VNN3-214ENST00000580813 LMF1Q96S06 567 aa7.51□□□□□ -1.21
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VNN3-214ENST00000580813 Q8N1X5 172 aa7.5□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.5□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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VNN3-214ENST00000580813 ZNF428Q96B54 188 aa7.49□□□□□ -1.21
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VNN3-214ENST00000580813 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.48□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 HS1BP3Q53T59 392 aa7.48□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.48□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.48□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 KATNBL1Q9H079 304 aa7.48□□□□□ -1.21
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VNN3-214ENST00000580813 FOXS1O43638 330 aa7.47□□□□□ -1.21
VNN3-214ENST00000580813 FZD7O75084 574 aa7.47□□□□□ -1.21
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