RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 STRNO43815 780 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TIMP1P01033 207 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FCER1AP12319 257 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 AKR1A1P14550 325 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CSF2RAP15509 400 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PLA2G5P39877 138 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ATP8B2P98198 1209 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TFF2Q03403 129 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MAP3K12Q12852 859 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MTMR3Q13615 1198 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 KCNA10Q16322 511 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MFSD5Q6N075 450 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CEP85Q6P2H3 762 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 USP34Q70CQ2 3546 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 AACSQ86V21 672 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SVOPQ8N4V2 548 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MB21D1Q8N884 522 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PIK3R5Q8WYR1 880 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 VWCEQ96DN2 955 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ASB2Q96Q27 587 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 KATNBL1Q9H079 304 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 BRD7Q9NPI1 651 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 HOXC10Q9NYD6 342 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RIPK3Q9Y572 518 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SIP14410 1827 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 NDUFB5O43674 189 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 BNIP3LO60238 219 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MBD4O95243 580 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ASGR1P07306 291 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MYOGP15173 224 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 TYRO3Q06418 890 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF365Q70YC5 407 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SPRED2Q7Z698 418 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CERS3Q8IU89 383 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 GRIN2DO15399 1336 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 EPOPA6NHQ4 379 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ARVCFO00192 962 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RFXAPO00287 272 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 IGSF3O75054 1194 aa4.74□□□□□ -1.65
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