RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAS1Q92839 578 aa37.42■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf70Q9BSU1 422 aa37.42■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 KATNAL1Q9BW62 490 aa37.42■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 FERMT3Q86UX7 667 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLFN12Q8IYM2 578 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARCH6O60337 910 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG7O95352 703 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAG4O95429 457 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMC6P62333 389 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGA7Q13683 1181 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CALCRLQ16602 461 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC26Q2I0M4 334 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF174Q15697 407 aa37.4■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALPK3Q96L96 1907 aa37.4■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIN2DO15399 1336 aa37.39■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMSYQ7Z589 1322 aa37.39■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BRB1 525 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBR1Q14596 966 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD15Q6UXT9 468 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC43A3Q8NBI5 491 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR64B1ANS9 1081 aa37.37■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARVCFO00192 962 aa37.37■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAS3O00219 553 aa37.37■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa37.37■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GNT9Q6UX72 402 aa37.37■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM50Q86XT4 487 aa37.37■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTMR9Q96QG7 549 aa37.37■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGR5O75473 907 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFNP31947 248 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSEN2P49810 448 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 RESTQ13127 1097 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFSD10Q14728 455 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBPF20Q3BBV1 942 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC45AQ9H3U1 944 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 AZI2Q9H6S1 392 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MROH7Q68CQ1 1323 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK7P50613 346 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 JAK3P52333 1124 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0753Q2KHM9 967 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFRKBQ6P4R8 1299 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM60Q9H2L4 133 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAV3Q9UKW4 847 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMM50Q9Y512 469 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHMP2AO43633 222 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTP1P59025 263 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP2R5CQ13362 524 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM60Q495X7 471 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLG1Q92896 1179 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCYT2Q99447 389 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 DISC1Q9NRI5 854 aa37.35■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHMP4BP1P59074 171 aa37.34■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 RDM1Q8NG50 284 aa37.34■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERAP1Q9NZ08 941 aa37.34■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHA12Q9UN75 941 aa37.34■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSAPP07602 524 aa37.33■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa37.33■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa37.33■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 BACH1O14867 736 aa37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52Z1P0C646 297 aa37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAT5BP51692 787 aa37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 AFAP1L1Q8TED9 768 aa37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPF3Q92784 378 aa37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOX2Q96NM4 488 aa37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR81Q562E7 1941 aa37.32■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXKP42681 527 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM160B1Q5W0V3 765 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIER3Q7Z3K6 550 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SESTD1Q86VW0 696 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAD1O00515 517 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVI5O60447 810 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC26A2P50443 739 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGDRQ13258 359 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM47CQ5HY64 1035 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SWSAP1Q6NVH7 229 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf32Q8N8J7 132 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF302Q9NR11 478 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TLE2Q04725 743 aa37.3■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPIRE1Q08AE8 756 aa37.3■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf31Q8N865 590 aa37.3■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms