RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 THAP9Q9H5L6 903 aa32.42■■■□□ 2.78
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 NR1I3Q14994 352 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTI2Q6NXR4 508 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 NLRX1Q86UT6 975 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPH2Q8IWU9 490 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPRASP2Q96D09 838 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 FRMD3A2A2Y4 597 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM49BA6NDI0 452 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 STAM2O75886 525 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIER3Q7Z3K6 550 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC8AQ8IWT6 810 aa32.4■■■□□ 2.78
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CTDNEP1-208ENST00000573600 INTS13Q9NVM9 706 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTBD7Q9P203 1132 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC10BA6NIK2 292 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 COBLO75128 1261 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 PMS1P54277 932 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARSHQ5FYA8 562 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC150Q8NCX0 1101 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 HPS3Q969F9 1004 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 NACC1Q96RE7 527 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 PFASO15067 1338 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 OSBPP22059 807 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM26FQ5R3K3 315 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 CENPPQ6IPU0 288 aa32.39■■■□□ 2.78
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC10A4Q96EP9 437 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 BHMT2Q9H2M3 363 aa32.39■■■□□ 2.78
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HERVK_113P62684 666 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCP11X2Q5H9J9 407 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXR2Q6PJQ5 311 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNERQ8NFT8 737 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATC1LQ9H0A9 340 aa32.38■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNJ18B7U540 433 aa32.37■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNJ12Q14500 433 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 IWS1Q96ST2 819 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 PKD2L1Q9P0L9 805 aa32.37■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 POTEJP0CG39 1038 aa32.37■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD35Q8N283 1001 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa32.37■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT31Q15323 416 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD40Q6AI12 368 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM114A1Q8IWE2 563 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYOCDQ8IZQ8 938 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDHR1Q96JP9 859 aa32.36■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A27O95847 323 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT76Q01546 638 aa32.34■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGOQ8TEQ8 1089 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEMA6BQ9H3T3 888 aa32.34■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa32.34■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RINT1Q6NUQ1 792 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 IRF2BP1Q8IU81 584 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 RDM1Q8NG50 284 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSG101Q99816 390 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAGR1Q9BTK6 254 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNMDO75829 334 aa32.32■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.76
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