RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568494.1

ZNRF1-208, Transcript of zinc and ring finger 1, human

TSL 2

Gene ZNRF1, Length 2,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNRF1-208	ENST00000568494	FANCG	O15287	622 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CCDC175	P0C221	793 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	AR	P10275	920 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	HSD17B4	P51659	736 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CEP55	Q53EZ4	464 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CPXCR1	Q8N123	301 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494		A0A0U1RQJ8	604 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	NFIB	O00712	420 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CHMP2A	O43633	222 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	MTMR2	Q13614	643 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	VWA3B	Q502W6	1294 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	COL20A1	Q9P218	1284 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	PPP2R5C	Q13362	524 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	DYDC2	Q96IM9	177 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	CHP1	Q99653	195 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	FZD1	Q9UP38	647 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	FLOT1	O75955	427 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLITRK3	O94933	977 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	EYA4	O95677	639 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ALAS1	P13196	640 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	VCAM1	P19320	739 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	GNG11	P61952	73 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	SPP2	Q13103	211 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	DCAF15	Q66K64	600 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	SULF1	Q8IWU6	871 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	TPH2	Q8IWU9	490 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	DNAJC7	Q99615	494 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	REEP2	Q9BRK0	252 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	NUP58	Q9BVL2	599 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRAF5	O00463	557 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	GAS7	O60861	476 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	MAN2A1	Q16706	1144 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	WDR24	Q96S15	920 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	NDST4	Q9H3R1	872 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	POLD4	Q9HCU8	107 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	RPTOR	Q8N122	1335 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	SFR1	Q86XK3	245 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	IL31RA	Q8NI17	732 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ZNRF1-208	ENST00000568494	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZBTB39	O15060	712 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	RSPH10B	P0C881	870 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ITGB5	P18084	799 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ERCC3	P19447	782 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CASQ1	P31415	396 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CASP5	P51878	434 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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