RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567065.5

INO80E-208, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-208ENST00000567065 PGM5Q15124 567 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 TCTN1Q2MV58 587 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 CNKSR3Q6P9H4 555 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 SEPT14Q6ZU15 432 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 PHKBQ93100 1093 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 FAM122AQ96E09 287 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 SLC26A6Q9BXS9 759 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 EPHX3Q9H6B9 360 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 EHMT1Q9H9B1 1298 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 BARHL2Q9NY43 387 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa17.11■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 MEIS2O14770 477 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 STAM2O75886 525 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 SCG2P13521 617 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 CCND2P30279 289 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 MCTP2Q6DN12 878 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 TRAF7Q6Q0C0 670 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 LRFN3Q9BTN0 628 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 NLRC5Q86WI3 1866 aa17.1■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 SMCO2A6NFE2 343 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 STXBP3O00186 592 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 HAS3O00219 553 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 PPFIA3O75145 1194 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 GJB5O95377 273 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 ADCY7P51828 1080 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 NTRK3Q16288 839 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 DGKDQ16760 1214 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
INO80E-208ENST00000567065 ESYT2A0FGR8 921 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 F2P00734 622 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 PSEN2P49810 448 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 ERVK-21P61565 698 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 PTK7Q13308 1070 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 BECN1Q14457 450 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 UBE2SQ16763 222 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 PPTC7Q8NI37 304 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 GDPD5Q8WTR4 605 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 RAD9AQ99638 391 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 ZBED2Q9BTP6 218 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 KATNAL1Q9BW62 490 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 SUGCTQ9HAC7 445 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.08■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 LINC01553A4QN01 128 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 PFKFB2O60825 505 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 AP3B2Q13367 1082 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 LAMC2Q13753 1193 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 MBTPS1Q14703 1052 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 MFSD10Q14728 455 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 PKN1Q16512 942 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 GNPTABQ3T906 1256 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 TYW1BQ6NUM6 668 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 C7orf31Q8N865 590 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 IL31RAQ8NI17 732 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 BICD2Q8TD16 824 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 WNT8BQ93098 351 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 EFCAB14O75071 495 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 RGS20O76081 388 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 DEXIO95424 95 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 GNA11P29992 359 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 SCRN1Q12765 414 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 CUL4AQ13619 759 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 IKBKEQ14164 716 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 HIC1Q14526 733 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 KIAA0753Q2KHM9 967 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 ZNF618Q5T7W0 954 aa17.06■□□□□ 0.32
INO80E-208ENST00000567065 HSCBQ8IWL3 235 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms