RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF8	P28908	595 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH1B1	P30837	517 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	NAB2	Q15742	525 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	EMB	Q6PCB8	327 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	STIM2	Q9P246	746 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	DNM3	Q9UQ16	869 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	TLR2	O60603	784 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	MYBL2	P10244	700 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	CRK	P46108	304 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559		Q4G0T1	1027 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		20.27	■□□□□ 0.84
RRN3-205	ENST00000563559	GGCX	P38435	758 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	EPHB4	P54760	987 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP4	P98171	946 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	NFIA	Q12857	509 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	AMN	Q9BXJ7	453 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	MEIS2	O14770	477 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	RAD21	O60216	631 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	MED24	O75448	989 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	RPA1	P27694	616 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	DOK7	Q18PE1	504 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ARSH	Q5FYA8	562 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	FAM20A	Q96MK3	541 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	20.26	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	BUB1	O43683	1085 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	NR2F2	P24468	414 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	CXCR5	P32302	372 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	KCNH2	Q12809	1159 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ASIC2	Q16515	512 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf74	Q6P047	294 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	PODN	Q7Z5L7	613 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D5	Q92609	795 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	MXD3	Q9BW11	206 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC18	Q9H819	358 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	POTEF	A5A3E0	1075 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	POTEI	P0CG38	1075 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	PRR16	Q569H4	304 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	POTEG	Q6S5H5	508 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	GAN	Q9H2C0	597 aa		20.24	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	PDXK	O00764	312 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	NCK2	O43639	380 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	STAT3	P40763	770 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	NNT	Q13423	1086 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	GIT2	Q14161	759 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	ALS2CL	Q60I27	953 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	IFT20	Q8IY31	132 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	CAVIN3	Q969G5	261 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	GMCL1	Q96IK5	515 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB7	Q99436	277 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	IDI2	Q9BXS1	227 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		20.23	■□□□□ 0.83
RRN3-205	ENST00000563559	AGPS	O00116	658 aa		20.23	■□□□□ 0.83

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